Sammakko on hieman arvoituksellinen sana. Se voisi liittyä erästä suutautia tarkoittavaan sanaan sammas. Oletusta tukee se, että muissakin kielissä tauti ja eläin liittyvät toisiinsa: esimerkiksi englannin frog ja saksan Frosch tarkoittavat molemmat sekä sammakkoa että sammastautia. Taudin aiheuttama ihottuma muistuttaakin (rupi)sammakon ulkonäköä. Tosin tämä ei selitä vielä sanan sammakko alkuperää, koska sammas on ilmeisesti johdos sammakko-sanasta eikä päinvastoin.
Toisen hyvin epävarman oletuksen mukaan sammakko liittyy toiseen sammas-sanaan, joka tarkoittaa muun muassa pylvästä, patsasta ja paalua ja on ehkä johdos sanasta sampo. Tämä yllättävä yhteys perustuu siihen, että sammakko tarkoittaa eläimen lisäksi myös erilaisten laitteiden kannattimia ja kiinnikkeitä (esimerkiksi myllyssä). Tosin nämä merkitykset ovat ilmeisesti ainakin osin myöhäisiä käännöslainoja; vrt. englannin frog ja venäjän žaba, žabka, joilla on samantyyppisiä merkityksiä.
Kaiken kaikkiaan sanan sammakko alkuperä on hämärän peitossa.